Conformément à l'édit royal de 1662, un hôpital général, dédié à Saint-Louis, est créé à La Rochelle en 1673 pour accueillir les indigents et les enfants orphelins ou abandonnés.

Déménagé en 1695 sur son site actuel, l'hôpital St-Louis connaît au XVIIIème siècle, sous la direction de l'ordre religieux des Filles de la Sagesse, une augmentation du nombre de ses pensionnaires (plus de 700 en 1733) et développe ses activités économiques et sociales malgré des difficultés financières chroniques : implantation d'une manufacture au sein de l'établissement pour occuper les pauvres, prise en charge des enfants trouvés, versement de pensions aux mères indigentes afin de prévenir les abandons.

A partir de 1765, avec l’ouverture du dépôt de mendicité de La Rochelle, l'hôpital se décharge des vagabonds, des mendiants, des déments ou des orphelins et entame, à partir de la Révolution, un long processus de médicalisation, qu'accompagne l'émergence de la notion d'assistance pour les plus faibles de la société.

Pour accueillir les malades mentaux, dont l'image sociale de personnes dangereuses laisse place progressivement à celle d'infortunés, un asile est construit à Lafond durant la Monarchie de Juillet. Le père du peintre écrivain Eugène Fromentin en est le premier directeur.

Le XXème siècle est marqué par les progrès spectaculaires de la médecine et le développement technologique. La différenciation des spécialités médicales entraîne une multiplication des services. Achevant sa laïcisation, l'hôpital poursuit le recrutement de professionnels de plus en plus qualifiés et spécialisés, et se place au coeur du système sanitaire local.
en 1948, l'hôpital départemental de Lafond est rattaché juridiquement à l'hôpital général
en 1976, le nouvel hôpital Saint-Louis est mis en service
en 1980 est créé le Centre d’Aide par le Travail  « Le Treuil Moulinier »
à partir de 1981, le Centre de Soins pour Personnes Agées « Fief de la Mare » accueille des patients en moyen et long séjours
en 1995, l’hôpital départemental de Lafond est renommé « Hôpital Marius Lacroix », du nom d'un résistant rochelais
en 1999, L'Institut de Formation en Soins Infirmiers est rattaché juridiquement au Centre Hospitalier
en 2003, ouverture du nouveau Centre d'oncologie et de radiothérapie
en 2004, ouverture de la Maison d'Accueil Spécialisée « La Fontaine du Roc »

Toutes ces grandes étapes jalonnent la longue et riche histoire hospitalière rochelaise.